Code Documentation

• datastructures package
  • Submodules
  • datastructures.Command module
  • Module contents
• dependency_graph package
  • Submodules
  • dependency_graph.graph module
  • Module contents
• pipeline module
• steps package
  • Submodules
  • steps.filterUniqueBam module
  • steps.filter_bam_ancient module
  • steps.vcf_to_fasta module
  • Module contents
• utils package
  • Submodules
  • utils.environment module
  • utils.isexe module
  • utils.isfile module
  • utils.which module
  • Module contents